由于男性生殖器畸形有不同类型，因此男性生殖器畸形的治疗需要根据疾病类型有针对性地进行。

一、家庭处理：

包皮过长、可翻起者，可经常清洗包皮。堡保持包皮腔清洁，防止感染。对于儿童包茎，可扩大包皮开口，反复将包皮翻起、复位，以利于暴露龟头。

二、住院治疗

1.包茎、包皮的治疗：对于成人包茎，需要进行包皮环切术。对于包皮嵌顿，需紧急手法复位，必要时进行背侧包皮切开术。

2.隐藏阴茎的治疗：非手术治疗包括包皮可以翻起以露出阴茎头的情况。手术是不必要的，因为有些患者会随着年龄的增长而好转，尤其是减肥后。手术治疗应暴露阴茎头，去除肉膜纤维索，用阴茎白膜或耻骨骨膜固定阴茎根部皮肤。避免损伤海绵体、阴茎神经和血管，避免单纯包皮环切术。手术的合适时机适合学龄前或以上的儿童。

3.治疗阴茎小：对于促性腺激素分泌不足者，常用人绒毛膜促性腺激素，其作用与黄体生成素、卵泡刺激素相似。例如，可注射绒毛膜促性腺激素，用促性腺激素释放激素类似物治疗儿童下丘脑功能障碍，效果良好。对于性腺功能障碍的患者，可以使用睾酮替代疗法，例如甲基睾酮。内分泌治疗无效者，可能存在雄激素受体异常。那些坚持是男性的人可以接受阴茎重建或假体植入，但大多数仍然接受变性手术。

4.无睾症：单侧无睾症一般不需要治疗。双侧睾丸缺失不能恢复生育能力，但如果堡保持男性性征，可以在青春期进行雄激素替代治疗，药物治疗可以包括雄激素和睾酮。

5.多睾症：多睾症一般不需要治疗。如果存在萎缩、恶变等病理情况，则应切除多余的睾丸。

6.隐睾：隐睾一旦确诊，应尽快治疗。出生后六个月，如果睾丸还没有下降到阴囊，自行下降到阴囊的机会很小。不能盲目等待，应积极治疗。