阴茎大小差异背后存在诸多因素。遗传因素是关键影响之一，就如同身高、外貌受家族基因遗传，阴茎尺寸也在很大程度上由遗传决定。若家族中男性普遍阴茎尺寸较小，个体出现同样情况的概率会相对较高。

　　发育阶段的影响也不容忽视。在青春期这个阴茎快速发育的时期，若身体缺乏关键营养物质，像蛋白质、维生素以及锌、硒等微量元素，可能阻碍阴茎正常生长。同时，长期不良生活习惯，如过度熬夜、缺乏运动，打乱内分泌平衡，也会干扰阴茎发育进程。

　　疾病因素同样会导致阴茎偏小。一些先天性疾病，如染色体异常引发的克氏综合征，会影响雄性激素分泌，进而抑制阴茎发育。后天患上睾丸炎、附睾炎等疾病，若未及时有效治疗，炎症长期刺激，也可能致使阴茎发育不良，尺寸小于正常范围。